Dr Chojnacka opracowała nowatorską metodę oczyszczania ścieków przemysłowych z jonów metali ciężkich z wykorzystaniem mikroalg, metodę umożliwiającą prognozowanie stężenia zanieczyszczeń w roślinach na podstawie znajomości składu gleby oraz metodę otrzymywania nowej generacji mineralnych dodatków na bazie biomasy mikro- i makroalg.